Antifúngico del grupo de las equinocandinas, activo principalmente sobre Candida y Aspergillus. Es más activo que los azoles sobre C. glabrata y C. parapsilosis. Respecto a otras equinocandinas ([element_ref id=1949]caspofungina[/element_ref], [element_ref id=1950]micafungina[/element_ref]), presenta una semivida de eliminación más prolongada (40-50 horas). Las equinocandinas inhiben la formación de la pared celular de los hongos, a diferencia del resto de antifúngicos. La asociación con [element_ref id=1941]anfotericina B[/element_ref] puede ser aditiva o incluso sinérgica.
Anidulafungina ha demostrado no inferioridad respecto a fluconazol en pacientes con candidiasis invasiva, especialmente no neutropénicos (Reboli et al, NEJM 2007).
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