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Buscar en Medline con Pubmed: guía de uso en español Actualizada el 22/02/2010

Índice de contenidos   National Library of Medicine
  1. ¿Qué es PubMed?.
  2. ¿Cómo iniciar una búsqueda en PubMed?.
  3. ¿Cómo limitar los resultados de nuestra búsqueda?
  4. Visualización de resultados.
  5. Recursos adicionales de interés.
  6. Mapeo automático de términos.
 Autores:

María Sobrido Prieto
Carlos González Guitián

Biblioteca del Complejo Hospitalario Universitario de A Coruña (CHUAC), Sergas, España.
  • Esta "Guía breve de uso" no recoge todas las opciones o posibilidades de búsqueda. La "Guía completa" está disponible en PubMed Help.



Documentos asociados:

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Guía breve de uso de PubMed


MEDLINE

Buscar con
PubMed
Descriptores en Ciencias de la Salud (MeSH) en inglés:
Medical Subject Headings (MeSH)
Descriptores en Ciencias de la Salud (DeCS) en español:
  1. HON select
  2. Bireme



1. ¿Qué es PubMed?

MEDLINE es la base de datos más importante de la NLM abarcando los campos de la medicina, oncología, enfermería, odontología, veterinaria, salud pública y ciencias preclínicas.

PubMed es un proyecto desarrollado por la National Center for Biotechnology Information (NCBI) en la National Library of Medicine (NLM). Permite el acceso a bases de datos bibliográficas compiladas por la NLM: MEDLINE, PreMEDLINE (citas enviadas por los editores antes de que se añadan todos los campos en los registros completos y sean incorporados a Medline), Genbak y Complete Genoma. Medline contiene subbases: AIDS, Bioethics, Cancer, Complementary Medicine, Core Clinical Journals, Dental Journals, Nursing Journals y PubMed Central.

Esta base de datos es de acceso gratuito. El modo de acceder a la misma es a través de http://www.ncbi.nlm.nih.gov/PubMed/.




2. ¿Cómo iniciar una búsqueda en PubMed?
Para iniciar la búsqueda en PubMed, esta base de datos ofrece dos posibilidades:




2.1. Búsqueda sencilla

Para realizar una búsqueda sencilla, introduzca el término o frase en el cuadro de búsqueda y pulse el botón Go o la tecla enter. 

Podemos limitar la búsqueda mediante:
  1. Operadores lógicos o booleanos (AND, OR, NOT) Importante: Los operadores booleanos AND, OR, NOT deben escribirse en mayúscula, ejemplo: fever OR hyperthermia, o bien FEVER OR HYPERTHERMIA.

  2. Truncamiento
    Permite recuperar todos los términos que poseen la misma raíz. Si colocamos un asterisco (*) al final de un término, busca todas las palabras que tengan la misma cadena de letras como raíz.
    Si escribimos neurol* se incluyen los términos neurology; neuroleptic; neurolekin; neurologic; etc. PubMed usa las primeras variantes del término truncado. No localiza frases, por ejemplo "infection*" incluye "infections", pero no "infection control".

  3. Calificadores de campos o etiquetas / tags
    Cada campo de la referencia se identifica mediante una etiqueta, que indica el campo específico al que corresponde. Para emplearlos se escribe el término seguido de la abreviatura.

     Tabla 1: Calificadores de campos o etiquetas / tags.
    Nombre del campo Abreviatura Descripción
    Affiliation - Dirección [AD, AFFL] Dirección y filiación institucional del primer autor y número de ayuda económica.
    All Fields - Todos los campos [ALL] Incluye todos los campos de búsqueda de PubMed.
    Author Name - Autores [AU, AUTH] Desde 2000 Medline no pone limite al nº de autores. Hasta 1999 incluía los 25 primeros autores seguido de la abreviatura et al. El formato para buscar un autor es Apellido, seguido de espacio y la/s primeras iniciales sin puntos (ej., Fauci AS). Se pueden omitir las iniciales al buscar.
    Corrected and republished from [CRF] Versión corregida y publicada nuevamente.
    Corrected and republished in [CRI] Artículo original que fue corregido y vuelto a publicar
    E.C./RN [RN, ECNO] Número asignado por la Comisión de Enzimas (E.C.). Número para designar una enzima en particular y el listado RN del Chemical Abstracts Service (CAS) Registry Numbers.
    Entrez Date -Fecha de ingreso [EDAT] Contiene la fecha que la cita fue agregada a PubMed, en el formato aaaa/mm/dd [edat], ej., 1998/01/10 [edat].
    Erratum for [EFR] Errata: cita el artículo original que necesita corrección.
    Full Author Name [FAU] Apellido y nombre completo del autor.
    Full Investigator [FIR] Apellido completo e inicial del nombre del investigador.
    Full Personal Name as Subject [FPS] Nombre personal como materia.
    General Note [GN] Información suplementaria o descriptiva relacionada con el documento.
    Grant Number [GR] Números de identificación de las agencias de financiación norteamericanas US PHS o Wellcome Trust.
    Issue - Número [IP, ISSUE] Número del volumen de la revista en la cual el artículo se encuentra publicado.
    Investigator [IR] NASA-investigador principal.
    Investigator Affiliation [IRAD] Afiliación NASA del investigador principal.
    Journal Name - Nombre de la publicación [TA, JOUR] La abreviatura del título de la revista, el título completo o el número ISSN (ej., J Biol Chem, Journal of Biological Chemistry, 0021-9258).
    Full Journal Title [JT] Nombre completo de la revista procedente de la NLM
    Language - Idioma [LA, LANG] El idioma en el cual el artículo fue publicado.
    MeSH Major Topic - MeSH tópico principal [MAJR] Término MeSH que cubre los aspectos más relevantes de un artículo
    MeSH Terms - Términos MeSH [MH,MESH] El vocabulario controlado de la NLM’s (Medical Subject Headings) sobre términos biomédicos que se usan para describir cada artículo de una revista científica en MEDLINE.
    Other Abstract [OAB] Resumen suministrado por un organismo colaborador de la NLM.
    Other Copyright Information [OCI] Otra información del Copyright.
    Other ID [OID] Otros datos de identificación del ID.
    Original Report In [ORI] Informe original asociado al sumario para el paciente.
    Other Term [OT] Términos no-MeSH adjudicados por otra organización (OTO).
    Other Term Owner [OTO] Organización que proporcionó otros datos del término.
    Owner [OWN] Siglas de la organización que proveyeron datos de la citación.
    Page - Página [PG, PAGE] Página inicial y final del artículo.
    Personal Name - Nombre personal [PS] Para buscar citas sobre un individuo como tema. Utilice las reglas como para buscar un autor.
    Place of Publication [PL] País de publicación de la revista.
    Publication Date - Fecha de publicación [DP, PDAT] La fecha en que el artículo fue publicado en el formato aaaa/mm/dd (ej. 1984/10/06). Un año con solo un mes (ej., 1984/03) mostrará todo lo de ese mes. Las fechas de publicación no están estandarizadas entre las publicaciones.
    Publication Type - Tipo de publicación [PT, PTYP] Describe el tipo de material que el artículo representa (ej., Review, Clinical Trials, Retracted Publications, Letters).
    Publishing Model [PUBM] Soporte del artículo de la publicación: impreso (print) o electrónico (electronic).
    Space Flight Mission [SFM] NASA- datos de la misión espacial.
    Subheading - Subencabezado [SH] Subencabezamientos utilizados para calificar de forma más precisa la búsqueda con términos MeSH.
    Subset - Subgrupos [SB] Permite elegir sobre que subbase de la base de datos Medline queremos buscar: Aids, Bioehics, Cancer, etc.
    Substance Name - Nombre de substancia [NM, SUBS] El nombre de una sustancia química tratada en el artículo (MEDLINE Name of Substance field).
    Summary For Patients In [SPIN] Sumario para pacientes.
    Status Tag [STAT] Estatus de la etiqueta en la NLM.
    Text Words - Palabras del texto [TW, WORD] Todas las palabras de los campos del título, resumen, términos MeSH, subencabezamientos, nombres de sustancias químicas, nombre de persona como tema y campos de identificación secundaria.
    Title Words - Palabras del título [TI, TITL] Palabras que se encuentran en el título de un artículo.
    Volume - Volumen [VI, VOL] El número del volumen de la publicación donde el artículo es publicado.
    PubMed Identifier (PMID) & MEDLINE Unique Identifier (UI)   Número de identificación unívoco de cada registro PubMed (PMID) o Medline (UI).





2.2. Búsqueda avanzada (Advanced search)

Esta pestaña ofrece varias posibilidades:




  1. History
    Muestra todas las búsquedas según el orden en que se hicieron precedidas del signo #. Para ver los resultados pulse en el número de resultados. Puede guardar hasta 100 búsquedas. Se pierde después de 6 horas de inactividad.
    Permite combinar las búsquedas o agregar términos a la existente utilizando el signo # antes del número de búsqueda ej.: #2 AND #6, ó #3 AND drug therapy.




  2. Search Builder

    Permite acceder a una lista de términos dentro de un campo específico ej.: MeSH Terms, Author Name, etc (ver Tabla 1) y seleccionar los términos para elaborar una estrategia de búsqueda utilizando los operadores booleanos: AND, OR y NOT.
    Por ejemplo, para ver los términos MeSH que comiencen con "duodenal", seleccione MeSH Terms del menú desplegable de la izquierda, introduzca el término y pulse Index.

    Puede continuar ampliando la estrategia seleccionando “add more search fields”.



3. ¿Cómo limitar los resultados de nuestra búsqueda?


La pestaña “limits” permite limitar la búsqueda de acuerdo a los siguientes criterios:





4. Visualización de resultados
Pueden seleccionarse las opciones de visualización mediante:
4.1. Barra de valores añadidos

Barra de valores añadidos
(Ampliar)


4.2. Display/Visualización de resultados

Las citas de PubMed por defecto se muestran en formato abreviado (summary). Los documentos pueden visualizarse en otros formatos:


4.3. Send to/Volcado de resultados de una búsqueda





Para guardar los resultados de una búsqueda, pulse “Send to”

¿Cómo ver los Vínculos / Links?
Related Articles: las citas tienen un vínculo que mostrará una selección de artículos que comparten palabras clave con el artículo seleccionado. PubMed compara las palabras del título, resumen y términos MeSH. Las citas se muestran de mayor a menor concordancia, no respeta un orden cronológico.

4.4. Acceso al texto completo del artículo

Una vez visualizado el resumen de un artículo, si aparece un recuadro con el enlace a la editorial, pulsamos el recuadro que llevará a la sede de la editorial donde solicitará las claves de suscriptor o el abono mediante tarjeta de crédito del importe para el acceso al texto completo del artículo. En el supuesto de que se encuentre gratuito (indicado como free, o bien que se encuentra en PubMed Central).


5. Recursos adicionales de interés.


5.1. MeSH Database

El Medical Subject Headings (Descriptores de Ciencias de la Salud) es un vocabulario controlado de términos biomédicos que identifican el contenido de cada artículo en la base de datos MEDLINE. La búsqueda en el MeSH Database permite mostrar términos MeSH en una estructura jerárquica a partir de 15 grandes categorías, seleccionar los términos MeSH para la búsqueda, limitar los términos MeSH a un concepto mayor (tema principal). Los descriptores MeSH pueden ser utilizados con subheadings, subencabezamientos que permiten concretar en uno o varios aspectos específicos el término.
Cuando introducimos un término que no es MeSH, el sistema nos indicará que no es un término MeSH, o bien mostrará el término aceptado.

Ej: si introducimos “Mongolism”, mostrará “Down syndrome”.



A continuación, si pinchamos el término, ofrece una descripción del término, seguido de los “subheadings”, la posibilidad de limitarlo al “Major Topic” (tema principal en el artículo, incluidos los términos específicos), o bien “Do Not Explode this term” (no explotar un término MeSH a otros más específicos).
Una vez seleccionados los criterios del término, para efectuar su búsqueda en PubMed, disponemos de dos opciones:
  1. Podemos pulsar “Link” (en el margen derecho del término MeSH), seleccionamos PuBMed y directamente nos realizará la búsqueda del MeSH seleccionado.
  2. Si deseamos utilizar los operadores booleanos AND, OR, NOT entre varios términos MeSH, debemos pulsar “Send to” y seleccionar el operador. A continuación escribimos un nuevo término repitiendo los pasos anteriores. Los términos que vayamos seleccionando irán apareciendo en el cuadro de búsqueda. Para comenzar la búsqueda pulsar “Search PubMed”.
La opción de la consulta del MeSH también está disponible desde Limits desde donde podemos limitar la búsqueda a la opción de MeSH (Date, Major Topics, Terms), pero debemos conocer el término MeSH aceptado, en caso contrario no lo localizará.

(*) Si tenemos problemas para encontrar un término en inglés, una buena opción es consultar el MeSH en español de HONselect o los Descriptotes de Ciencias de la Salud (DeSC) de Bireme, que describen el término, su estructura jerárquica y su equivalente en inglés.


5.2. Journal Database

Esta opción permite buscar las revistas indizadas en Medline por diversos criterios: por título, abreviatura o el ISSN (International Standard Serial Number), o bien aquellas que permiten acceder al texto completo desde PubMed.

Ejemplo: por título completo: Enfermedades Infecciosas y Microbiología Clínica; por la abreviatura internacional: Enferm Infecc Microbiol Clin; o también por su ISSN: 0213-005X.

Una vez localizada una revista, si deseamos que recupere todas las referencias incluidas en PubMed, pulsamos “Link” y seleccionamos “PubMed”.


5.3. Single Citation Matcher

Buscador de referencias que parte del nombre de la revista, volumen, edición, número de página y año de publicación. Debe introducir los datos conocidos de la referencia. PubMed le informará si no encuentra resultados. Es una herramienta muy útil para localizar referencias bibliográficas incompletas, verificar datos o simplemente localizar una referencia.




5.4. Batch Citation Matcher

Permite buscar los números PMID (PubMed IDs) que identifican a cada artículo o de varios artículos a la vez, de forma similar al Single Citation Matcher. Requiere datos bibliográficos (revista, volumen, página, etc.) en un formato específico.

Título abreviado revista|año publicación|volumen|primera página|nombre autor|???

proc natl acad sci u s a|1991|88|3248|mann bj|P32022-1|

Para ejecutarlo debemos realizar los siguientes pasos:
  1. Recuperamos la referencia en el Batch Citation Matcher.
  2. Copiamos el IDs, lo marcamos y pulsamos en "Edición" "copiar".
  3. Marcamos la referencia donde deseamos vincularlo (también suele ponerse a continuación de la referencia [Medline] [Resumen], ...)
  4. Seleccionar la opción de "insertar hipervínculo" y aceptamos. La palabra o texto seleccionado queda vinculado al número del resumen de Medline.



5.5. Clinical Queries

Es un buscador especializado que tiene incorporados "filtros metodológicos":





5.6. My NCBI

Para activar esta opción, debemos registrarnos previamente en “Register” (recuadro parte superior derecha de la página). Si ya nos hemos registrado, para activar la opción de “My NCBI”, debemos introducir nuestras claves en “Sign In” (parte superior derecha de la página).



Permite:




6. Mapeo automático de términos
El Mapeo de un término, enlaza automáticamente un término o frase que no es término MeSH, al término MeSH que mejor lo describe. Los términos no MeSH introducidos son comparados (en este orden) contra los siguientes índices de búsqueda: MeSH; revistas; lista de frases e índice de autores:

En el supuesto de que PubMed no encuentre resultados, descompone la frase hasta encontrar resultados. Si fueran positivos, combinará los términos mediante el operador AND y buscará en todos los campos.


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